Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1099959	1100001	43	28 [0]	[0] 14	ycdY	conserved hypothetical protein

TTCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCG  >  W3110S.gb/1099916‑1099958                                           | ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2418679/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:817145/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:72872/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:722048/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:589053/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:573311/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:566820/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:486909/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:383477/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:28788/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2857668/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2797165/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2476453/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1012954/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:229677/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2074614/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2063694/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1907097/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1774757/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1752950/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1747430/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1657721/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1616680/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1449913/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1255107/43‑1 (MQ=255) ttCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:1168843/43‑1 (MQ=255)     ctctATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:2444775/39‑1 (MQ=255)      tctATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCg  <  1:189705/38‑1 (MQ=255)                                           | TTCGCTCTATTACCGCCAACCACAAGATCCTTTACTGGTGCCG  >  W3110S.gb/1099916‑1099958

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑