Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1116245	1116298	54	38 [0]	[0] 6	mdtG	predicted drug efflux system

TTCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCGTGGTG  >  W3110S.gb/1116204‑1116244                                         | ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2807498/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:106889/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2426286/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2554569/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2578383/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2684728/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2704727/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:274105/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2794613/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2258910/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2838345/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:343212/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:378885/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:571180/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:728612/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:753993/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:785580/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:834652/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1584200/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:120404/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1261772/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1296919/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1336409/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:143641/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1468299/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1549163/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1561421/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2255699/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1645126/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1747412/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1750598/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2038702/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2059696/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2144842/41‑1 (MQ=255) ttCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2199120/41‑1 (MQ=255)  tCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:1803242/40‑1 (MQ=255)  tCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:725976/40‑1 (MQ=255)   cGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCgtggtg  <  1:2373566/39‑1 (MQ=255)                                         | TTCGGGTCCGATTCGATCGCCAAGTTTGCCGAGTCGTGGTG  >  W3110S.gb/1116204‑1116244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑