Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1131924	1131975	52	28 [0]	[0] 2	flgA	assembly protein for flagellar basal‑body periplasmic P ring

CTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGC  >  W3110S.gb/1131862‑1131923                                                              | cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTTCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2120286/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2363523/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:854486/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:467016/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:396054/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:31460/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2887856/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2844916/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2475139/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2448182/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1014641/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2357897/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1585178/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1486871/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1224514/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1215374/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1121346/62‑1 (MQ=255) cTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1061006/62‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2255172/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1841120/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1569879/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2519842/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2553195/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2720753/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:1248996/61‑1 (MQ=255)  tgtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:588564/61‑1 (MQ=255)   gtgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:2073073/60‑1 (MQ=255)    tgCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGc  <  1:529111/59‑1 (MQ=255)                                                              | CTGTGCGACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGC  >  W3110S.gb/1131862‑1131923

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑