Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1141902	1141993	92	20 [0]	[0] 13	flgL	flagellar hook‑filament junction protein

GAGTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCA  >  W3110S.gb/1141840‑1141901                                                              | gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1950541/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:852955/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:799257/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:662273/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:2870710/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:2706650/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:2577912/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:234594/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:2215588/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:2193994/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1104695/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1907790/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1906901/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1850807/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1805898/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1742219/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1539448/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1468398/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1376627/62‑1 (MQ=255) gagTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCa  <  1:1109874/62‑1 (MQ=255)                                                              | GAGTGTACTTAGCCAGGTCACCACTGCTATCCAGAATGCTCAGGAAAAAATTGTCTACGCCA  >  W3110S.gb/1141840‑1141901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑