Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1142470	1142507	38	22 [0]	[0] 12	flgL	flagellar hook‑filament junction protein

GCGCTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAT  >  W3110S.gb/1142409‑1142469                                                             | gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2328245/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:95177/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:932633/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:733549/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:670742/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:453808/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:351414/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2686536/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2580944/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2446956/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2443635/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1195298/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2179425/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:2132635/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1852499/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1640904/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1537816/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1500977/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1479316/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:1261309/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:122371/1‑61 (MQ=255) gcgcTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAt  >  1:121937/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCGCTTTAGGGCAAACGCAGCAGATGAGCGATCTGGTTGATGTGGACTGGAATGCAACTAT  >  W3110S.gb/1142409‑1142469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑