Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1163923	1163933	11	41 [0]	[0] 25	ycfL	hypothetical protein

TACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTG  >  W3110S.gb/1163864‑1163922                                                           | tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:287352/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2285699/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2288224/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2373251/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2394245/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:245587/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2533489/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2830730/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2839384/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2855606/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2205027/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2874078/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2886941/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:395235/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:454298/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:467945/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:495950/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:673084/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:696342/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:880650/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1823859/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1074479/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1177346/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1207638/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:134210/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1389387/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1404079/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1423487/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1516685/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1600028/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1678531/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1037614/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1833833/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1876584/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1914236/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1932565/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:19644/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1975735/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:1978941/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2028086/1‑59 (MQ=255) tACTGCTGGTGGGCTGTCGTTAACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTg  >  1:2535173/1‑59 (MQ=255)                                                           | TACTGCTGGTGGGCTGTCGTTCACATCCGGAAATTCCGGTGAATGATGAGCAATCGCTG  >  W3110S.gb/1163864‑1163922

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑