Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1190971 1190977 7 27 [0] [0] 19 phoQ sensory histidine kinase in two‑compoent regulatory system with PhoP

CTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTA  >  W3110S.gb/1190909‑1190970
                                                             |
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2401120/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:999231/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:977368/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:804492/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:799824/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:451009/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:365671/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:328014/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2526939/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2478748/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2428652/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2427626/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2120487/62‑1 (MQ=255)
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cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1741148/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1656032/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1650881/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1551782/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1512875/62‑1 (MQ=255)
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cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1360878/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1310505/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1213808/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCCAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:1030179/62‑1 (MQ=255)
cTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2723855/61‑1 (MQ=255)
 ttCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:840873/61‑1 (MQ=255)
                       tGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTa  <  1:2056945/39‑1 (MQ=255)
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CTTCCCGCACTTCCTGCAACTGTTGCTGTATCGAATGATCTCCACTCAGCAAGAGGCTGGTA  >  W3110S.gb/1190909‑1190970

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: