Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1208581	1208603	23	34 [0]	[0] 6	ymfQ	conserved hypothetical protein

CCTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCG  >  W3110S.gb/1208519‑1208580                                                              | ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1135520/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:682427/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:6296/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:53634/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:486278/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:479927/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:42346/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:402548/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:370605/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2705452/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:270016/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2539400/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2526435/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2423480/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2284094/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2186059/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1234786/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1300459/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1389579/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1641654/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:194805/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1992359/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2146969/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGGCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:311834/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGCTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:2196103/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGGGGTCATCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1255024/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGGGGGCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1242687/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGGCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:193561/62‑1 (MQ=255) ccTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGGCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:378772/62‑1 (MQ=255)         cGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:70735/54‑1 (MQ=255)            cACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:599229/51‑1 (MQ=255)                   gccgccCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:675022/44‑1 (MQ=255)                   gccgccCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1128414/44‑1 (MQ=255)                       cccGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCg  <  1:1842553/40‑1 (MQ=255)                                                              | CCTGTTATCGGCACTGTTGCCGCCCGGTCCGGTGTGGTCAGCCAGCGATCCGGCGATTGCCG  >  W3110S.gb/1208519‑1208580

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑