Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1213952	1213991	40	33 [0]	[0] 33	elbA/ycgX	hypothetical protein/hypothetical protein

CCTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTG  >  W3110S.gb/1213890‑1213951                                                              | ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:1241261/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:1244316/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:2679240/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:1636071/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:2913402/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:1787910/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:1801634/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:709795/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  >  1:1054412/1‑62 (MQ=255) ccTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTATCAATTTTTg  >  1:2303979/1‑62 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:693993/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2909404/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:30164/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:372233/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:406980/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:467934/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:261634/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:818658/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:905232/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:947486/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2853798/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2755098/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2650222/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2482583/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:242321/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2159123/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2137803/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:2010361/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:1979101/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:1709549/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:1437048/61‑1 (MQ=255)  cTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:1071456/61‑1 (MQ=255)                 taataaTGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTg  <  1:396596/46‑1 (MQ=255)                                                              | CCTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAGCATGACATGAGAATAAGGTTTCAATTTTTG  >  W3110S.gb/1213890‑1213951

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑