Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1245687	1245883	197	40 [0]	[0] 8	ycgR	protein involved in flagellar function

AGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAAC  >  W3110S.gb/1245625‑1245686                                                              | aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACTAATCATACAGGCGGAaac  <  1:71212/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACCGGCGGAaac  <  1:1796905/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:318031/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2143963/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2273277/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:263488/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2775737/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2777121/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2783726/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2832184/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2897568/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1932635/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:557943/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:722441/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:790738/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:862098/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:87032/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:892161/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:895429/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:896498/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1553449/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1024572/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:108601/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1156332/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1168808/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1214755/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1285008/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1465963/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1523587/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1643934/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1643975/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1730074/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1787108/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1811535/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1830679/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1905358/62‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCACATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1001923/62‑1 (MQ=255)  ggCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1582610/61‑1 (MQ=255)  ggCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:1041006/61‑1 (MQ=255)                 aGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAaac  <  1:2883223/46‑1 (MQ=255)                                                              | AGGCTTTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAAC  >  W3110S.gb/1245625‑1245686

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑