Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1252566	1252643	78	31 [0]	[0] 8	[dhaR]	[dhaR]

CAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGT  >  W3110S.gb/1252504‑1252565                                                              | cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2437543/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:878059/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:800169/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:787097/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:652797/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:637620/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:532995/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:444204/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:396234/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:321060/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2790033/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2776854/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2733716/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2592400/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:254360/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:252069/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1087499/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2303933/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2292258/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:2162989/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1899118/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1858154/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1769516/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1711752/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1707303/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1512077/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1363338/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1321939/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1267205/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1159431/1‑62 (MQ=255) cAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGt  >  1:1157895/1‑62 (MQ=255)                                                              | CAAGGGAAAAGAAAATTAGCCCAAATTATGTTTCATAGTGAAACATATGCTTTAATGAATGT  >  W3110S.gb/1252504‑1252565

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑