Missing coverage evidence...
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TTCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTC  >  W3110S.gb/1255807‑1255868                                                              | ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:333153/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2279663/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2344458/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2368280/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2448655/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2666071/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2826325/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2839220/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2839232/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2866697/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2879681/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2916768/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2227109/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:362447/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:476092/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:488673/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:517630/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:5830/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:825730/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:871409/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:883403/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:916298/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:950669/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1494074/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1046044/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1101582/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1117088/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1217517/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1405610/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1419202/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1476378/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1477903/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:103317/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1563646/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:157602/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:17978/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1984743/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2033811/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2099857/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2109019/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2149449/62‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:2161626/62‑1 (MQ=255)  tCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCATTACTc  <  1:1270115/61‑1 (MQ=255)  tCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1063963/61‑1 (MQ=255)  tCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:216680/61‑1 (MQ=255)  tCCCGTTGTGGCCTCGCTGCACTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTc  <  1:1118918/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTCCCGTTGTGGCCTCGCTGCCCTGGTTGCGGATAGCCAATACGTGATTACCAGCACTACTC  >  W3110S.gb/1255807‑1255868

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑