Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1321570	1321617	48	31 [0]	[0] 25	trpD	fused glutamine amidotransferase (component II) of anthranilate synthase and anthranilate phosphoribosyl transferase

CTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACG  >  W3110S.gb/1321508‑1321569                                                              | cTCGTGCCGCTAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:804574/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCTCAGTACCTCAAGAACg  <  1:2663852/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:833899/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1070730/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:690741/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:622580/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:604101/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:600759/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:596916/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:5907/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:522674/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:516264/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:454208/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:338375/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:2688071/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:2658824/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:2377753/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:2073179/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:2061745/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1995661/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1977947/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:194415/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1941467/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1783841/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1582248/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1380910/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1249865/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:114802/62‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:1072007/62‑1 (MQ=255) cTCGTGACGCCAGTGCTGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:308288/62‑1 (MQ=255)  tCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACg  <  1:609149/61‑1 (MQ=255)                                                              | CTCGTGCCGCCAGTGCGGTGACTCTGTCGTAAGCGGAACCACTGCGCAGTACCTCAAGAACG  >  W3110S.gb/1321508‑1321569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑