Missing coverage evidence...
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AGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACCACCCACACCCA  >  W3110S.gb/1360438‑1360499                                                              | aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:1021520/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:1287558/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:1441422/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:1696110/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:1908839/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:239132/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:2507568/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:2512883/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:2588031/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:2889572/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:2926414/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:304254/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:391047/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:468398/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:644739/1‑62 (MQ=255) aGGTTGACGCTCTTCAGACTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACcacccacaccca  >  1:1986339/1‑62 (MQ=255)                                                              | AGGTTGACGCTCTTCAGATTCGCGGCGGTTAAAATGGCGACGAAGGTTACCACCCACACCCA  >  W3110S.gb/1360438‑1360499

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑