Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1431441	1431543	103	46 [0]	[0] 7	stfR	predicted tail fiber protein

AACGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGACC  >  W3110S.gb/1431386‑1431440                                                       | aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:631501/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:242361/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:2426314/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:2517413/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:2540032/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:2651390/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:337389/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:338557/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:412512/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:446144/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:477369/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:5541/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:2413056/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:706963/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:729401/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:769226/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:778023/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:780698/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:839206/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:841353/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:905280/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:992675/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:999852/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:159305/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1074328/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1076022/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1092897/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1138454/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1156972/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1177322/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1282907/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:136129/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1403963/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1481637/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1561497/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1040461/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1601088/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1623025/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1636580/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1678646/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1705469/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1740180/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1747798/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:1824113/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:188090/55‑1 (MQ=255) aaCGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGAcc  <  1:222270/55‑1 (MQ=255)                                                       | AACGAATGCTTCAGCGTCACTACAATCAGCAGCCACATCTGCATCCACCGCGACC  >  W3110S.gb/1431386‑1431440

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑