Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1536537	1536554	18	43 [0]	[0] 16	nhoA	N‑hydroxyarylamine O‑acetyltransferase

CAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAG  >  W3110S.gb/1536476‑1536536                                                             | cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2649325/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1851030/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1980703/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2015592/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2046652/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2052820/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2060561/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2078267/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2447625/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2634996/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1955290/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2734786/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:2923353/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:418226/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:652043/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:747333/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:852090/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:955991/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:972903/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:980599/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1411156/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1291392/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1292290/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1307817/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:134360/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1348457/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:138255/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:139168/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1409185/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1270777/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1243645/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1624718/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1644493/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1645852/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1726638/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1745302/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGGTAg  <  1:2396073/61‑1 (MQ=255) cAAGAACAATTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:925558/61‑1 (MQ=255)  aaGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:104897/60‑1 (MQ=255)   aGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:652209/59‑1 (MQ=255)   aGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1562171/59‑1 (MQ=255)     aaCAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1210462/57‑1 (MQ=255)          tttGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAg  <  1:1455212/52‑1 (MQ=255)                                                             | CAAGAACAGTTTGGTCTGGGCGTGGATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAG  >  W3110S.gb/1536476‑1536536

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑