Missing coverage evidence...
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ATCATCATGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGTGCAT  >  W3110S.gb/1565427‑1565488                                                              | atcatcatGCTTTCCTTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAAAACACCAGGCGtgcat  >  1:2129748/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:344500/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2499353/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2595271/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2597924/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2610978/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2642552/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2674934/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:269074/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2760109/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2849830/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2886929/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:341386/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2431341/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:403682/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:437249/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:462556/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:466493/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:521188/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:580746/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:615307/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:657605/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:709720/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:728592/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:969526/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1763867/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1109805/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:115666/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1244650/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1316243/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1512579/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1516711/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1550478/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:163632/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1658319/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1746667/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1763760/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:243426/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1775173/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1818775/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1884270/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1992631/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:200305/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2147565/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:232384/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2328410/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:2330287/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgcat  >  1:1032941/1‑62 (MQ=255) atcatcatGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGtgaat  >  1:1864376/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATCATCATGCTTTCCGTGATTTCTACCGTCAGCTGGTGGCCGTCAATACCCCAGGCGTGCAT  >  W3110S.gb/1565427‑1565488

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑