Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1591336	1591345	10	24 [0]	[0] 9	ydeT	hypothetical protein

CGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAC  >  W3110S.gb/1591275‑1591335                                                             | cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2045317/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:613342/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:491851/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:279286/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2771857/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:277182/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2743224/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2481561/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:241080/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2247171/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2165711/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:216086/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1026895/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2044528/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:2032063/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1901929/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1898524/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1822300/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1755192/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1736465/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1434247/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1295000/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAc  <  1:1079632/61‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCCTTTGAc  <  1:1863800/61‑1 (MQ=255)                                                             | CGGCAGCAGAGTGCCATAAACCCCCGATAGATTGGTCATGCCGCCTTTCAAATCGTTTGAC  >  W3110S.gb/1591275‑1591335

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑