Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1604445	1604484	40	16 [0]	[0] 2	ego	fused AI2 transporter subunits and ATP‑binding components of ABC superfamily

TTCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAT  >  W3110S.gb/1604383‑1604444                                                              | ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACTGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:244698/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAATAAATCCTCAt  <  1:2493852/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:1011686/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:1087811/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:1274996/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:2034225/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:2098970/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:2648817/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:2831001/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:789161/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:86265/62‑1 (MQ=255) ttCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATACTCAt  <  1:512737/62‑1 (MQ=255) ttCAAACAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:879194/62‑1 (MQ=255) ttCAA‑CAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACAAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:2482347/61‑1 (MQ=255)  tCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:1168003/61‑1 (MQ=255)  tCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAt  <  1:554793/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTCAACCAACCGGAACAAGCTGCACGGACATTATCCGGTGGCAACCAGCAAAAAATCCTCAT  >  W3110S.gb/1604383‑1604444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑