Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1638888	1638903	16	13 [0]	[0] 2	ydfO	hypothetical protein

GTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAGAGA  >  W3110S.gb/1638826‑1638887                                                              | gTTTTATTCTGTGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:1881668/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:1046622/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:1113050/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:1872042/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:1986510/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:2085691/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:2183034/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:2837018/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:401833/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:495622/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:878513/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:943446/62‑1 (MQ=255) gTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAgaga  <  1:99349/62‑1 (MQ=255)                                                              | GTTTTATTCTGAGCTAAAACGTCACAATGTCTCACATTACATTTACTATTTAGCCACAGAGA  >  W3110S.gb/1638826‑1638887

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑