Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1692222	1692224	3	24 [0]	[0] 6	ydgA	conserved hypothetical protein

CGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAC  >  W3110S.gb/1692160‑1692221                                                              | cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2197499/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:901357/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:658400/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2851279/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2802238/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2773145/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2556227/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2455136/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2423597/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2265639/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2223680/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2211777/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1082893/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2058916/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:2030297/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:200453/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1961465/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1836625/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1449587/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1376658/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1342928/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1253960/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:116249/62‑1 (MQ=255) cGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAc  <  1:1089998/62‑1 (MQ=255)                                                              | CGGATAGACGCAGTTAACGAATACAACCAGAAAGTGCAGTTGACCTTTAATAATCTGAAAAC  >  W3110S.gb/1692160‑1692221

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑