Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1720740	1720793	54	12 [0]	[0] 40	ydhH	conserved hypothetical protein

ACAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAG  >  W3110S.gb/1720794‑1720854 |                                                             aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCAtt                            >  1:1248938/1‑35 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATtc                           >  1:2337040/1‑36 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCt                     >  1:524535/1‑42 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGtt                >  1:2005312/1‑47 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2761871/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:240139/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2402480/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2403738/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2447716/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2545106/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2618653/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2653967/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2669974/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:840986/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2907102/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:47699/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:508435/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:591752/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:64059/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:720749/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1043925/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:230347/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1428808/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1433100/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1450396/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1667327/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1672953/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1739983/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1852696/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1930572/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1950153/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1956613/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:1980118/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2046784/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2237944/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2265287/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2349699/1‑61 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagca   >  1:2530352/1‑60 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCcagca   >  1:1248483/1‑60 (MQ=255) aCAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTAGGTTGGGTGAGCcagcag  >  1:2150061/1‑61 (MQ=255) |                                                             ACAGATTGGCGATGCCGCCAATATTGAGCACCATTCGTCGCTCGGTTGGGTGAGCCAGCAG  >  W3110S.gb/1720794‑1720854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑