Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1827260	1827276	17	18 [0]	[0] 30	spy	envelope stress induced periplasmic protein

GGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCA  >  W3110S.gb/1827277‑1827338 |                                                              ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACTCa  <  1:346338/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2587118/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:936894/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:62990/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:491185/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:460472/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:408889/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:389267/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:313921/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:292930/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2898154/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2784927/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2714305/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2694066/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:265493/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1084781/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2585091/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2542715/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2475848/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2436642/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2229446/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2204920/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:2184456/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1742056/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1553827/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1481344/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:135331/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1320991/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1232810/62‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCa  <  1:1195790/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGTAGAGGCAACAAACAGTGCAGTTAATTTACGCA  >  W3110S.gb/1827277‑1827338

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑