Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1964322	1964323	2	4 [0]	[0] 10	flhE	flagellar protein

TTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACG  >  W3110S.gb/1964324‑1964385 |                                                              ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGTAACg  >  1:1681396/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:128599/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:2219857/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:2273186/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:2515535/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:2898623/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:468918/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:48562/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:563146/1‑62 (MQ=255) ttGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACg  >  1:740308/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACG  >  W3110S.gb/1964324‑1964385

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑