Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1965116	1965252	137	7 [0]	[1] 12	flhA	predicted flagellar export pore protein

CAAACAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTGG  >  W3110S.gb/1965252‑1965314  |                                                              cAAACAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTgg     <  1:1112180/60‑2 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:1001056/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:1138813/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:1389426/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:1420548/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:1623752/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:2586424/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:2594813/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:2742212/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:39971/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:468647/62‑1 (MQ=255)  aaaCAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTgg  <  1:571509/62‑1 (MQ=255)  |                                                              CAAACAGCTCTGCGGCATGCTGGCTAATGAGGTGGTTAAGATGCGTTGCTACCACCGTGCTGG  >  W3110S.gb/1965252‑1965314

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑