Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1965357	1965388	32	9 [0]	[0] 7	flhA	predicted flagellar export pore protein

AATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATC  >  W3110S.gb/1965389‑1965448 |                                                            aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1106369/1‑60 (MQ=255) aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1636161/1‑60 (MQ=255) aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2223730/1‑60 (MQ=255) aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2614676/1‑60 (MQ=255) aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2861852/1‑60 (MQ=255) aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:489431/1‑60 (MQ=255) aaTGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:955973/1‑60 (MQ=255) |                                                            AATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATC  >  W3110S.gb/1965389‑1965448

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑