Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1976426	1976484	59	17 [0]	[0] 19	cheA	fused chemotactic sensory histidine kinase (soluble) in two‑component regulatory system with CheB and CheY

AACGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGCGCG  >  W3110S.gb/1976485‑1976545 |                                                             aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2211932/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:597926/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2608764/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2536832/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2499786/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2466457/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2355714/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2337904/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2221268/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:221639/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:1291415/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2194543/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2180319/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:2008196/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:1894366/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:1776972/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:1378719/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:1294660/61‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGcgcg  <  1:1293770/61‑1 (MQ=255) |                                                             AACGTTGTCAGATGTCCCAGTTCTTCTTCCAGCAGGTCGACTTCCCCGGCCTTCAGGCGCG  >  W3110S.gb/1976485‑1976545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑