Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2004319	2004343	25	5 [0]	[0] 35	fliC	flagellar filament structural protein

TTGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCTT  >  W3110S.gb/2004344‑2004392 |                                                 ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:693087/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2819835/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:290211/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2915942/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2925329/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:450447/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:503965/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:540453/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:57736/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:270115/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:719488/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:748164/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:753773/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:789270/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:940749/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:971858/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:990449/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:997859/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1687930/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1072925/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1221131/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1264892/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1296959/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:133440/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1545490/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1638258/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1678499/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1047994/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:1854791/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2219950/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:228581/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2316843/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2522364/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCtt  <  1:2687723/49‑1 (MQ=255) ttGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATAC‑GGACTGCGCtt  <  1:2104374/48‑1 (MQ=255) |                                                 TTGGACACTTCGGTCGCATAGTCGGCGTCCTGAATACGGGACTGCGCTT  >  W3110S.gb/2004344‑2004392

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑