Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2006621	2006626	6	6 [0]	[1] 6	fliD	flagellar filament capping protein

CTATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCT  >  W3110S.gb/2006626‑2006688  |                                                              cTATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGc   >  1:565255/1‑62 (MQ=255)  tATGACGCCAGTGCCAGCAGCATCGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCt  <  1:969834/62‑1 (MQ=255)  tATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCt  <  1:113622/62‑1 (MQ=255)  tATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCt  <  1:14055/62‑1 (MQ=255)  tATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCt  <  1:2413793/62‑1 (MQ=255)  tATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCt  <  1:2622644/62‑1 (MQ=255)  |                                                              CTATGACGCCAGTGCCAGCAGCAACGGTATGGAGGTCTCGGTTGCCGCCCAGAATGCGCAGCT  >  W3110S.gb/2006626‑2006688

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑