Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2015894	2015952	59	19 [0]	[0] 19	fliF	flagellar basal‑body MS‑ring and collar protein

CAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTG  >  W3110S.gb/2015953‑2016013 |                                                             cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATc    >  1:79671/1‑59 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:1379425/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:853026/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:740236/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:666235/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:589764/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:499482/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:434795/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:277889/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:2302583/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:218720/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:2126564/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:1569138/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:1562243/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:1428711/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:1112747/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATATg  >  1:896979/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCACCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:556747/1‑61 (MQ=255) cAGCGCCGGTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTg  >  1:2774651/1‑61 (MQ=255) |                                                             CAGCGCCGTTGCTGGTCTGCCGCCGGGAAACGTCACGCTGGTGGATCAGGGCGGACATCTG  >  W3110S.gb/2015953‑2016013

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑