Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2016058	2016085	28	28 [0]	[0] 23	fliF	flagellar basal‑body MS‑ring and collar protein

CGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTA  >  W3110S.gb/2016086‑2016131 |                                              cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:2494523/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:880412/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:81833/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:790637/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:573877/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:532394/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:392658/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:2925826/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:2870366/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:2631709/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:2562564/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:255463/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:105417/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1999935/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1984888/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1869384/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1716092/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1682277/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1540640/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1499558/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:146370/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:123884/46‑1 (MQ=255) cGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTa  <  1:1116788/46‑1 (MQ=255) |                                              CGTATTCAGCGGCGTATTGAAGCGATCCTGTCGCCTATTGTTGGTA  >  W3110S.gb/2016086‑2016131

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑