Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	27938	27960	23	6 [0]	[0] 56	rihC	ribonucleoside hydrolase 3

CGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCC  >  W3110S.gb/27961‑28022 |                                                              cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCATGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:805152/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCctggctg         >  1:632373/1‑55 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCctggc           >  1:1196555/1‑53 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgcgc   >  1:1469277/1‑61 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2676371/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:289477/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2883056/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2877820/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2869107/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2822063/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2792424/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:354718/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:255619/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:254298/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:24859/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2383622/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2331184/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2904115/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2909649/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1154836/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:369366/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:575820/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:578829/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:633211/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:705017/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:780974/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:894241/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:959137/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:965208/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2264969/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1104360/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1165339/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1246975/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1350722/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1393009/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1459703/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1481793/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1530115/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1606611/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1647128/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1734594/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1762625/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:182256/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1845347/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1942111/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1951209/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1985742/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2075940/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2100678/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:21339/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:2280944/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTg      >  1:1822416/1‑58 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGcc  >  1:1183321/1‑62 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGcc  >  1:1161714/1‑62 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCCCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:983855/1‑59 (MQ=255) cGGCAGTATGCAAAGCGGCGTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTgc     >  1:1308095/1‑59 (MQ=255) |                                                              CGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCC  >  W3110S.gb/27961‑28022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑