Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2345241	2345242	2	15 [0]	[0] 44	yfaL	adhesin

GATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTA  >  W3110S.gb/2345243‑2345304 |                                                              gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2891958/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2198210/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2290996/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2377660/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2517131/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2559073/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2565800/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2614890/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2639085/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2725637/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2884393/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2129104/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:404248/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:410855/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:431399/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:498912/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:595946/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:624537/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:648296/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:770550/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:881994/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:92576/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1719361/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1033265/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1035084/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:107250/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1136751/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1259954/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1311044/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1335242/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1341289/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1347966/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1649464/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1027586/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:173507/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:174996/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1754791/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1760153/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1775828/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1805811/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1809343/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:1967085/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2097094/62‑1 (MQ=255) gATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTa  <  1:2110707/62‑1 (MQ=255) |                                                              GATAGTGCTGCCATCCTCTTCAATTTCCGTCGAATGGGGATCGTGATAATAATTCAGATCTA  >  W3110S.gb/2345243‑2345304

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑