Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2411176	2411248	73	36 [0]	[0] 33	lrhA	DNA‑binding transcriptional repressor

AGCAACAAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCA  >  W3110S.gb/2411249‑2411310 |                                                              agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTa                       >  1:404742/1‑41 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTAt    >  1:1636592/1‑60 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATc   >  1:2505681/1‑61 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATc   >  1:2237700/1‑61 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATc   >  1:52828/1‑61 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:43364/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2626090/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2708565/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2728249/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:356562/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2565510/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:553915/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:638387/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:816628/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:823472/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:953348/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:980547/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2582717/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1089016/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2387184/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2181641/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:202414/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1745318/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1609771/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1417004/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1393994/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1335996/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1327197/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1278354/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1178315/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:1094216/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATAGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:792291/1‑62 (MQ=255) agcaacaAATGTTCTCAGCAGATCGAAGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCa  >  1:2665489/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGCAACAAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCA  >  W3110S.gb/2411249‑2411310

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑