Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2443488	2443511	24	31 [0]	[0] 50	flk	predicted flagella assembly protein

CTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCA  >  W3110S.gb/2443512‑2443573 |                                                              cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAACGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1824275/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2636675/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2030051/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2077373/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2204540/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:225454/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2345680/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:235890/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2395776/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2461205/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2467268/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2519866/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2621462/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2021603/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2714260/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:271739/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2893729/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:2910500/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:313980/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:437433/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:564007/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:655788/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:829010/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:883768/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:921428/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:998317/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1538112/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1049557/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1141756/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1153242/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1182381/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:118908/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1207815/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1212251/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1291349/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1330097/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1429536/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1461374/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1541575/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1570510/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:168396/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1780200/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1860968/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1865822/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1869072/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:187413/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1883001/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1953607/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1990242/62‑1 (MQ=255) cTTAATGACGAAAGCGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCa  <  1:1035182/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTTAATGACGAAAGTGACCTCACTGACGCAACAGCAAAGAGCAGAACTGTGGGCGGGTATCA  >  W3110S.gb/2443512‑2443573

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑