Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2488493	2488615	123	29 [0]	[0] 30	emrK	EmrKY‑TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component

ATTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAT  >  W3110S.gb/2488616‑2488677 |                                                              aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCTTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2222652/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTTATTCCAt  <  1:2715794/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:24625/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:949383/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:941497/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:791798/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:791122/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:791062/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:741604/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:653995/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:605344/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:551936/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:402137/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2620390/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2532999/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1028977/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2246129/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2193874/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2060798/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:2013659/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1856254/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1797062/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1630951/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1594250/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1383756/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1316468/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1293313/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1132959/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAt  <  1:1049087/62‑1 (MQ=255) aTTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATCTCTTCTAATTCCAt  <  1:621707/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATTGGATCTGCATTCCCCGTGACATAGGCGTCATCTGTACTAATCATGTCTTCTAATTCCAT  >  W3110S.gb/2488616‑2488677

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑