Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2499622	2499690	69	12 [0]	[0] 21	yfdX	hypothetical protein

CCTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGT  >  W3110S.gb/2499691‑2499752 |                                                              ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:2511085/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:976838/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:958814/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:932101/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:892516/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:87569/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:788266/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:337159/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:2675251/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:261584/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:2537569/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:1140434/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:250971/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:2111675/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:2094405/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:194825/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:1896570/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:1894669/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:1512145/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:1511567/62‑1 (MQ=255) ccTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGt  <  1:1200920/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCTTGTTCAGAGATACGCTCTGCTGCCGCTGCCGTTTTCTGGGTTTGCTGAACTTGCTGAGT  >  W3110S.gb/2499691‑2499752

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑