Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2513032	2513073	42	15 [0]	[0] 25	ypdG	predicted enzyme IIC component of PTS

GTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAATT  >  W3110S.gb/2513074‑2513134 |                                                             gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCatgat                     >  1:1537307/1‑42 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1853550/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:842802/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:688542/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:2714602/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:2712911/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:2704930/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:2520737/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:2368467/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:2328184/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:215125/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1970455/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1924849/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:113118/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1812512/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:170884/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1695887/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1620961/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1336744/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1328381/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1320695/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:130851/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1155187/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAtt  >  1:1150505/1‑61 (MQ=255) gTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAAt   >  1:814296/1‑60 (MQ=255) |                                                             GTCGAAACCGGAGAATTTCCCGCTATTAAGAGCATCCATGATGCCGATCTCAGCAGGAATT  >  W3110S.gb/2513074‑2513134

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑