Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	60053	60068	16	12 [0]	[0] 22	rluA	pseudouridine synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32)

TTCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAC  >  W3110S.gb/60069‑60130 |                                                              ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCa   >  1:2698105/1‑61 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2485240/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:980207/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:830961/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:725434/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:449267/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:428070/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:351868/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2858262/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2686748/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2640160/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:107988/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2477741/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2412950/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:2117219/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1934377/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1827184/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1745243/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1724475/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1707850/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1594524/1‑62 (MQ=255) ttCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAc  >  1:1463292/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTCGGCTCGCGCTCGCGGAACTGGCGTTTTAACTCCCGCTCCGCGGCTTTGGTCAGCGCCAC  >  W3110S.gb/60069‑60130

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑