Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2734272	2734308	37	8 [0]	[0] 24	rluD	23S rRNA pseudouridine synthase

AGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCG  >  W3110S.gb/2734309‑2734370 |                                                              aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGt                >  1:1476265/1‑48 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTac              >  1:1035608/1‑50 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2070269/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:735580/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:355237/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:351752/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2920392/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2680766/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:263041/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2525716/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2330345/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2191845/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2113825/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:2000594/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1872592/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1823567/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1816261/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1796016/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:163750/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1459211/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1375300/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:1282071/1‑62 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgc   >  1:2391389/1‑61 (MQ=255) aGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACACGCGCCAGGATGTACCACCAGGTcgcg  >  1:143846/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGCAACGCATTCAGTACCGTGCCATCCGGGTTACCCGCGCCAGGATGTACCACCAGGTCGCG  >  W3110S.gb/2734309‑2734370

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑