Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2755659	2755663	5	12 [0]	[0] 8	intA	integrase

CTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAT  >  W3110S.gb/2755664‑2755724 |                                                             cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:1117491/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:1131154/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:1945580/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:2171451/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:2321944/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:770609/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:783319/61‑1 (MQ=255) cTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAt  <  1:888014/61‑1 (MQ=255) |                                                             CTATCTGATGGGGCTCTTGCTATTCTGGAAATGATGAAGCCTCTCAGTGGTGGCCGAGAAT  >  W3110S.gb/2755664‑2755724

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑