Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2755812	2755864	53	11 [0]	[0] 23	intA	integrase

GGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCG  >  W3110S.gb/2755865‑2755926 |                                                              ggaTTTCCACTTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCTTcg  <  1:2520774/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2517171/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:889342/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:834900/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:684361/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:668042/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:624939/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:441065/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:361406/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2766253/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2734250/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2579420/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:1458890/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:247145/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2466046/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2372604/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2279019/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2264697/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:2143003/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:1793528/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:1709836/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:1709408/62‑1 (MQ=255) ggaTTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTcg  <  1:1509124/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGATTTCCACCTGATGTCATTGAAGCAGCGCTTGCTCATGTAGACAAAAATGAGGTGCGTCG  >  W3110S.gb/2755865‑2755926

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑