Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2777740	2777743	4	31 [0]	[0] 23	ypjA	adhesin‑like autotransporter

ATCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGC  >  W3110S.gb/2777744‑2777804 |                                                             aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2247375/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:98009/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:752237/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:528087/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:416752/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:402139/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:327612/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2923061/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2894528/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2867359/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:255410/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2292554/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:1100452/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2227046/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2137760/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2095167/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:2020739/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:1882206/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:1838778/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:1671968/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:1494008/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGc  <  1:1493028/61‑1 (MQ=255) aTCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGGCTGGc  <  1:1358677/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATCGGGAGTAGGGTCTGGTTTTGGATTTGGGTCTGGCTTTGGATCGGGTTTTGGGTCTGGC  >  W3110S.gb/2777744‑2777804

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑