Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2780579	2780582	4	11 [0]	[0] 13	ypjA	adhesin‑like autotransporter

CCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAG  >  W3110S.gb/2780583‑2780643 |                                                             ccaGAATAAACTTCGATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:1904104/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:1347611/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:1397735/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:1509927/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:1680273/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:1796198/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:2523431/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:2562328/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:2643531/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:323384/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:367614/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:577162/1‑61 (MQ=255) ccaGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg  >  1:986049/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAG  >  W3110S.gb/2780583‑2780643

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑