Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2848849	2848861	13	86 [1]	[0] 31	hycA	regulator of the transcriptional regulator FhlA

ATGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGA  >  W3110S.gb/2848862‑2848922 |                                                             aTGGTGTGGCTGTTTAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:2075896/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAgg   >  1:2452230/1‑60 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAgg   >  1:1985241/1‑60 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:712009/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:2701837/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:2867791/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:426084/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:544369/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:622139/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1237198/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:784456/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:810046/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:812871/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:866084/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:871653/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:940170/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:978392/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:2448886/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:2196520/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1988027/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1986659/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1795873/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1725870/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1612698/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1495717/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1422433/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:139475/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1283924/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1240578/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:1072017/1‑61 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGAAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGa  >  1:985148/1‑61 (MQ=255) |                                                             ATGGTGTGGCTGTTAAAGCCATCCGCCAGGGTGACGTAAATGCGAAAATGTTCAAAAAGGA  >  W3110S.gb/2848862‑2848922

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑