Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2996976	2996988	13	25 [0]	[0] 31	ygeQ	hypothetical protein

GCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTT  >  W3110S.gb/2996989‑2997050 |                                                              gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGt                  >  1:2061418/1‑46 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:252887/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:729980/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:668148/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:55635/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:460667/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:40801/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2906696/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2824430/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2815396/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2775971/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2673702/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2662739/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2616330/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2610736/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2557550/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:1008007/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2509764/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:249938/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2218538/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2213611/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2179916/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:2165744/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:1952915/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:182320/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:1791165/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:123996/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:1142357/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:109439/1‑62 (MQ=255) gCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCtttttt  >  1:1093418/1‑62 (MQ=255) gCATCAGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGc              >  1:48556/1‑50 (MQ=255) |                                                              GCATCCGCTTAATCTGGTCGGGCGTAGACATATAATCCCACAGGGTGAGCAGAACCTTTTTT  >  W3110S.gb/2996989‑2997050

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑