Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3189193	3189201	9	7 [0]	[0] 19	yqiH	predicted periplasmic pilin chaperone

CTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTT  >  W3110S.gb/3189202‑3189263 |                                                              cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACAtt            >  1:225078/1‑52 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:2432838/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:964870/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:816475/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:525464/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:484111/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:2829320/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:2712824/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:265227/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:244061/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:1156968/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:2204863/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:1773449/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:1754976/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:1464642/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGt         >  1:1381238/1‑55 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATAttt  >  1:299837/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATAttt  >  1:1733080/1‑62 (MQ=255) cTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATAttt  >  1:1360661/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTTTGGTGGATTAAGTTTTTATGAAATAAACTGCCCTGTAGTAAATAACATTTGTAATATTT  >  W3110S.gb/3189202‑3189263

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑