Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3295694	3295761	68	18 [0]	[0] 35	yraO	DnaA initiator‑associating factor for replication initiation

GCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCT  >  W3110S.gb/3295762‑3295822 |                                                             gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2706446/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2262466/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:226474/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2321033/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2353297/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2389799/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2542289/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:263065/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2683329/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1200885/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2835159/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:456861/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:495472/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:575025/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:736283/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:847431/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:96115/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2110117/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1063745/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1316593/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1406510/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1508993/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1758231/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1776545/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1911098/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1915610/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1973383/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:1976998/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:198404/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2023993/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2027312/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2033380/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2051364/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCt  <  1:2211398/61‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAAATTCCGCt  <  1:963018/61‑1 (MQ=255) |                                                             GCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAACAAAATCCTCTGTTGTGGTAATGGAACTTCCGCT  >  W3110S.gb/3295762‑3295822

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑