Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3312423	3312454	32	19 [1]	[0] 25	truB	tRNA pseudouridine synthase

CGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACGG  >  W3110S.gb/3312455‑3312516 |                                                              cGAGGCAAATCGGCTACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCCCCGGTATGc           >  1:1731062/1‑53 (MQ=39) cGAGGCAAATCGGCAAGATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1931719/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCa                         >  1:581662/1‑39 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2028632/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:848472/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:78554/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:77065/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:746973/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:327986/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2760698/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2581260/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2371372/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2126882/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1062219/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2007691/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:198842/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1791143/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1593817/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1590552/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1395960/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1337335/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1094459/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:1093369/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTACAGCGCACCGGTATGCCCGGCACgg  >  1:2884818/1‑62 (MQ=255) cGAGGCAAATCGGCAAAATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCAGGCACgg  >  1:832669/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGAGGCAAATCGGCAACATGCCGGTCGCCAGCGGGTCCAGCGCACCGGTATGCCCGGCACGG  >  W3110S.gb/3312455‑3312516

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑