Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3540519	3540539	21	21 [0]	[0] 11	rhaB	rhamnulokinase

CCAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCA  >  W3110S.gb/3540540‑3540601 |                                                              ccAGTTAATGGCGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:1946972/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:1324295/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:2099865/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:2142356/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:258216/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:338960/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacca  >  1:518234/1‑62 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacc   >  1:1434077/1‑61 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacc   >  1:2697151/1‑61 (MQ=255) ccAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcacc   >  1:394901/1‑61 (MQ=255) ccAGGTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGcac    >  1:976648/1‑60 (MQ=255) |                                                              CCAGTTAATGACGCTGGATGAACTCAACAATGTGGATGATTTCCGTCAGGTCGTCAGCACCA  >  W3110S.gb/3540540‑3540601

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑